Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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BEST4Q8NFU0 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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