Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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