Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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