Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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