Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms