Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZIC1Q15915 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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