Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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