Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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