Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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