Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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