Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms