Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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