Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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