Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms