Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms