Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms