Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RUNX2Q13950 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms