Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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