Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms