Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATRQ13535 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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