Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
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TOP3AQ13472 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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TOP3AQ13472 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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TOP3AQ13472 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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TOP3AQ13472 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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TOP3AQ13472 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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