Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SP140Q13342 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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SP140Q13342 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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