Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATMQ13315 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATMQ13315 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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