Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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