Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms