Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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