Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms