Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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