Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM32Q13049 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms