Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms