Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms