Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms