Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ATRXP46100 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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