Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRMP28827 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPRMP28827 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
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PTPRMP28827 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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