Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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