Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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ERVV-1B6SEH8 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ERVV-1B6SEH8 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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