Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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