Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXQ1Q9C009 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXQ1Q9C009 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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