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| FOXQ1 | Q9C009 | AIF1-202 | ENST00000376049 | 524 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.92 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | SNORA70.6-201 | ENST00000383934 | 134 nt | BASIC | 4.92 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | ENPP2-201 | ENST00000075322 | 2651 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.92 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | MYNN-203 | ENST00000544106 | 4815 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.92 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | COPB2-205 | ENST00000507777 | 3034 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | AL731566.1-201 | ENST00000620490 | 1937 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | DOPEY1-202 | ENST00000349129 | 8210 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | PTPN12-206 | ENST00000435495 | 2526 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | SUMO1P2-201 | ENST00000452524 | 304 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | AC097486.1-201 | ENST00000515331 | 210 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | RNU6-470P-201 | ENST00000515954 | 104 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | AC105031.1-201 | ENST00000518550 | 476 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | RNU6-323P-201 | ENST00000521915 | 107 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | PYM1-205 | ENST00000547925 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | AL049839.1-201 | ENST00000556151 | 657 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | VN1R85P-201 | ENST00000601587 | 426 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | MIR92B-201 | ENST00000607575 | 96 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | AC100812.1-201 | ENST00000607622 | 580 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | AC004696.1-201 | ENST00000614345 | 607 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | YWHAEP7-201 | ENST00000617508 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXQ1 | Q9C009 | FABP2-201 | ENST00000274024 | 2478 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | AC011755.1-201 | ENST00000623763 | 2049 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXQ1 | Q9C009 | AL137003.2-201 | ENST00000606924 | 2538 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
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