Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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