Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ZBED9Q6R2W3 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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