Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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COL24A1Q17RW2 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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