Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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