Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms