Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms