Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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