Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CNGA3Q16281 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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