Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms