Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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