Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHHQ15465 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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