Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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